Το Σπήλαιο Μιλάτου βρίσκεται 2,5 χλμ έξω από το χωριό Μίλατος στην απότομη πλαγιά ενός φαραγγιού και έχει έκταση 2100 τ.μ.
Ο αριθμός των σταλακτιτών και των σταλαγμιτών στο Σπήλαιο Μιλάτου είναι μικρός, αλλά προσφέρει μια υπέροχη εικόνα. Η εκπληκτική διάταξη των πυλώνων χωρίζει το σπήλαιο σε πολυάριθμα σπήλαια.
Το παρεκκλήσι του Αγίου Θωμά στη σπηλιά τιμά την καταστροφή του έτους 1823. 3.600 άνδρες, γυναίκες και παιδιά αναζήτησαν καταφύγιο στο σπήλαιο αλλά έπρεπε να παραδοθούν μετά από 15 ημέρες και στη συνέχεια είτε σκοτώθηκαν είτε κακομεταχειρίστηκαν ή ακόμα και πούλησαν στην Αίγυπτο ως σκλάβοι από τους τουρκικά στρατεύματα κατοχής.